对洱海的3种鲤鱼——洱海鲤(C．barbatus)、春鲤(C．longipectoralis)和杞麓鲤(C．carpio chila)线粒体DNA(mtDNA)进行了限制性片段长度多态(RFLP)分析和mtDNA控制区(D-loop)序列测定。

mtDNA的RFLP及D-loop区的序列比较都揭示出洱海3种鲤鱼之间的遗传差异远小于异域分布的鲤属鱼类物种之间及其他鱼类的同属种间的遗传差异。对洱海鲤属鱼类种间如此小的遗传差异唯一合理的解释就是:它们确是由同域分化而形成的。